31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2724 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3058  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  50.29 
 
 
711 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2724  putative phage associated protein  100 
 
 
703 aa  1422    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000314154  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  51.55 
 
 
373 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  29.63 
 
 
1115 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  27.04 
 
 
1056 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  25 
 
 
1283 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  21.16 
 
 
1111 aa  54.3  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  27.14 
 
 
734 aa  53.9  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  24.71 
 
 
1201 aa  52.4  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  24.91 
 
 
1339 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.32 
 
 
1300 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  36.28 
 
 
1297 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.73 
 
 
1263 aa  51.2  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.27 
 
 
1280 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  25 
 
 
1301 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  25.46 
 
 
1301 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  25.06 
 
 
1300 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.5 
 
 
1302 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  28.43 
 
 
1252 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.2 
 
 
1297 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1082  hypothetical protein  38.81 
 
 
721 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.949845 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  30.07 
 
 
1296 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  27.96 
 
 
1302 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  25.46 
 
 
1300 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  25.46 
 
 
1300 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  34.09 
 
 
1206 aa  45.8  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  27.93 
 
 
1286 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  24.22 
 
 
1290 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  24.07 
 
 
1133 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  27.5 
 
 
742 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.52 
 
 
1302 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>