46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1646 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 1483 aa  2991    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  56.04 
 
 		 1296 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  56.67 
 
 		 1306 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  56.94 
 
 		 1296 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  56.85 
 
 		 1305 aa  706    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  57.1 
 
 		 1297 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  56.79 
 
 		 1296 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  49.38 
 
 		 1279 aa  575  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  47.95 
 
 		 1117 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  46.99 
 
 		 1339 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  46.99 
 
 		 1263 aa  532  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  46.34 
 
 		 1313 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  47.28 
 
 		 1286 aa  522  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  48.37 
 
 		 1300 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  48.37 
 
 		 1300 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  48.06 
 
 		 1300 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  48.76 
 
 		 1301 aa  516  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  45.68 
 
 		 1285 aa  512  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  46.17 
 
 		 1300 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  47.36 
 
 		 1301 aa  506  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  45.74 
 
 		 1283 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  46.49 
 
 		 1301 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  45.77 
 
 		 1284 aa  493  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  44.39 
 
 		 1252 aa  489  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  45.43 
 
 		 1297 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  45.09 
 
 		 1287 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  45.2 
 
 		 1280 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.15 
 
 		 1300 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.5 
 
 		 1290 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.19 
 
 		 1302 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  44.04 
 
 		 1302 aa  443  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  43.73 
 
 		 1302 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  36.87 
 
 		 996 aa  365  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1111 aa  310  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1206 aa  278  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1201 aa  262  3e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  32.72 
 
 		 752 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  31.66 
 
 		 754 aa  183  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3132  hypothetical protein  40.55 
 
 		 734 aa  139  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00254954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1990  hypothetical protein  41.23 
 
 		 742 aa  139  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000570978  normal  0.0169131 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3718  hypothetical protein  33.65 
 
 		 215 aa  115  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1056 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1076 aa  102  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0569  hypothetical protein  23.9 
 
 		 931 aa  74.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000706719  unclonable  6.43821e-20 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1124 aa  68.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1124 aa  69.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>