72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2065 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  54.17 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  54.72 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  51.55 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  51.23 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  50.31 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  50.31 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  48.15 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  47.53 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  47.53 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  42.31 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  38.56 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  41.82 
 
 		 169 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  41.21 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  39.33 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  37.91 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  35.33 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  40 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  35.42 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  38.04 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  36.88 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  40.38 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  40.38 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  38.82 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  39.74 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  36.13 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  31.29 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  36.02 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  36.13 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  34.64 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  35.46 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  33.1 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  33.75 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  33.97 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  32.88 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  27.74 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  25.95 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  27.22 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  30.63 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  30.63 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  29.03 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  28.3 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  24.29 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  30.19 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  29.45 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  27.78 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  31.65 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  29.2 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  29.11 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  28.68 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  21.94 
 
 		 277 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  26.47 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  26.47 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  26.43 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  26.25 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  25.69 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  28.28 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  29.22 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 87 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0464615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25.53 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  25.53 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  30.77 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25.32 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  23.29 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  22.22 
 
 		 166 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  25.48 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  25.48 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  24.2 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  25.32 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  26.03 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  24.82 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>