54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1988 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6089  DinB  100 
 
 		 191 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  100 
 
 		 191 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  71.2 
 
 		 190 aa  291  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  76.54 
 
 		 163 aa  270  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  43.95 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  40.13 
 
 		 178 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  38.99 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  36.2 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  37.74 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  34.55 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  33.1 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  32.64 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  33.99 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  27.71 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.22 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  24.68 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  28.93 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  30.63 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  26.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  26.25 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  26.25 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  28.48 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25.32 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  26.25 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  25.62 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  25.95 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  27.74 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  26.25 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  25.62 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25.32 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  29.27 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  25.6 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  24.14 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  23.6 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  30.06 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  27.71 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  24.38 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  25.3 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  27.91 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.03 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  25.16 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  43.64 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  28.75 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  27.33 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  24.22 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  23.75 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  23.26 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  23.12 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  26.09 
 
 		 167 aa  44.7  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  23.12 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  24.06 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  22.37 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  25.34 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  24.42 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>