23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0362 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  100 
 
 		 162 aa  339  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  38.51 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  40.4 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  38.46 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  36.2 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  36.2 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  36.2 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  34.84 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  33.33 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  32.47 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  31.85 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  29.87 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  26.92 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  32.17 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  27.12 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  21.52 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  21.52 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  30.67 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  25.62 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  30.67 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  26.92 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  26.17 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  29.33 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>