17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2157 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  83.83 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  44.19 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  41.92 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  45.68 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  38.46 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  34.32 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  38.73 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  33.1 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  33.1 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  35.04 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  32.72 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  28.57 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  30.99 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  28.48 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  29.73 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  21.34 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>