38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0488 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  35.29 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  30.58 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  27.12 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  24.44 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  29.61 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  22.29 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  28 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  28.36 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  26.9 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  26 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  27.12 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  21.95 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  37.04 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  28.29 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  31.09 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  20.83 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  35.85 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  32.81 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  31.75 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  24.06 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  24.06 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  30.77 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  29.73 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  38.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  22.31 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  20.34 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  41.82 
 
 		 169 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  20 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  20 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  34.92 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  20 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  32.61 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  20 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3539  hypothetical protein  26.56 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.509353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3282  hypothetical protein  26.56 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0481005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  35 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  35 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>