19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0987 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  100 
 
 		 172 aa  351  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  25.88 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  37.04 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  30.49 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  28.8 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  23.21 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  20.63 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  23.91 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  28.1 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2370  DinB family protein  22.14 
 
 		 152 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00332574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  28.57 
 
 		 174 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  25.93 
 
 		 173 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  22.44 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  28.81 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  28.81 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  28.81 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  28.81 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  20.61 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  34.43 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>