37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0789 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  45.73 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  33.75 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  33.13 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  31.06 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  30.52 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  30.72 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  29.3 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  28.77 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  28.57 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  28.03 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  27.92 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  26.75 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  26.75 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  26.75 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  26.32 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  26.8 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  25.19 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  23.95 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  26.49 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  24.84 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  25.68 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  24.82 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  27.21 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  26.43 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  25.81 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  26.04 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  27.17 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  24.1 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  21.71 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  19.87 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  32.26 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  26.28 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  24.26 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  28.57 
 
 		 202 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  21.62 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  28.8 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>