26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0178 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  100 
 
 
154 aa  318  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1058  DinB family protein  79.87 
 
 
154 aa  267  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0211  DinB family protein  38.61 
 
 
155 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.574334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  27.41 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  28.03 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  26 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3574  group-specific protein  28.57 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4801  DinB family protein  26.49 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0317403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6083  DinB family protein  25.49 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  32.26 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  26.57 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0790  DinB family protein  35.06 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  30.99 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  26.57 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  31.51 
 
 
167 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  22.38 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  31.82 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>