21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4454 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4801  DinB family protein  58.23 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0317403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  48.54 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.580078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3953  hypothetical protein  34.01 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.113123  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2760  hypothetical protein  30.5 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0790  DinB family protein  30.13 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2671  hypothetical protein  26.29 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3332  hypothetical protein  29.26 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0553624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3998  hypothetical protein  28.99 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0343  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000152379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6083  DinB family protein  25.81 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2983  DinB family protein  28.03 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  27.81 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  26.62 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1257  DinB family protein  22.37 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  26.57 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  26.17 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  35.09 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  24.84 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4167  DinB family protein  24 
 
 		 166 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0325153  hitchhiker  0.00159328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  32.84 
 
 		 172 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>