27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4801 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4801  DinB family protein  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0317403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  58.23 
 
 
176 aa  179  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  58.13 
 
 
181 aa  177  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.580078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3953  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.113123  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2760  hypothetical protein  30.07 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2671  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0343  hypothetical protein  26.71 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000152379  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3332  hypothetical protein  30.15 
 
 
186 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0553624  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  27.14 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3331  hypothetical protein  29.32 
 
 
182 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0878199  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  27.66 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  26.49 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1058  DinB family protein  25.17 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  26.24 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  26.21 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0211  DinB family protein  24.49 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.574334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0821  hypothetical protein  20.77 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  28.28 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  27.59 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  27.59 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2983  DinB family protein  25.85 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  26.9 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  26.71 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  26.81 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  24.29 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>