31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3373 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.580078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4801  DinB family protein  58.13 
 
 		 159 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0317403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  51.59 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3332  hypothetical protein  26.06 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0553624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2671  hypothetical protein  29.24 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3953  hypothetical protein  29.56 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.113123  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0343  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000152379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3998  hypothetical protein  29.91 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2760  hypothetical protein  24.11 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3331  hypothetical protein  26.47 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0878199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0211  DinB family protein  24.18 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.574334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  26.85 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  25.49 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.46 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  22.44 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  25.16 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  23.08 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  24.52 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0455  hypothetical protein  20.86 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3093  hypothetical protein  22.73 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0091  hypothetical protein  25.37 
 
 		 153 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  25.66 
 
 		 165 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  38.71 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  38.71 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1058  DinB family protein  25.17 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>