24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1276 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2209  DinB family protein  38.55 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  36.75 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  36.75 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  36.14 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  36.53 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  35.54 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  34.34 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  34.34 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  28.82 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  29.24 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  29.17 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  26.85 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.580078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  25.47 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4801  DinB family protein  27.66 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0317403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  23.46 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  28.82 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4545  DinB  46.34 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.104149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  53.12 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  47.22 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>