24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4545 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4545  DinB  100 
 
 
172 aa  351  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.104149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  60.23 
 
 
172 aa  225  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  35.98 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  37.75 
 
 
166 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0081  DinB  33.73 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  32.12 
 
 
165 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  29.94 
 
 
165 aa  84  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  31.4 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  26.63 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  41.18 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  36.47 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  36.47 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  36.47 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  36.47 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  39.71 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  46.34 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  28.89 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0211  DinB family protein  23.88 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.574334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>