57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2200 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  99.48 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  90.1 
 
 		 192 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  62.63 
 
 		 193 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  49.72 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  49.72 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  49.17 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  53.07 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  45.55 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  34.97 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  40.38 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  34.1 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  35.98 
 
 		 171 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  35.58 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  38.85 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  31.87 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  35.37 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  29.88 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  32.32 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3027  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0464615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  32.75 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  31.67 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  27.81 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  31.93 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  31.29 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  30.91 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  32.93 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  30.25 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  31.71 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  28.48 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  25.31 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  26.55 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  27.39 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  25.47 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  27.39 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  30.82 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  23.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  20.13 
 
 		 277 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  24.4 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  24.14 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  24.14 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  25.93 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  24.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  24.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25.9 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  29.31 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  28.92 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  24.11 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  27.11 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  27.11 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  24.12 
 
 		 170 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  28.02 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  38.71 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.580078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  24.84 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>