68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0794 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  100 
 
 
166 aa  346  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  41.72 
 
 
166 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  41.21 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  43.59 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  43.59 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  43.59 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  43.59 
 
 
174 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  41.82 
 
 
174 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  42.95 
 
 
170 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  43.59 
 
 
174 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  42.95 
 
 
174 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  41.21 
 
 
174 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  35.33 
 
 
169 aa  104  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  34.73 
 
 
169 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  30.32 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  31.06 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  28.14 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  27.04 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  29.14 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  26.01 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  26.01 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  22.94 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  27.78 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  25.95 
 
 
173 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  26.09 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  25.47 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  24.69 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  26.03 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  21.69 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  22.67 
 
 
181 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  27.27 
 
 
164 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  25 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  27.08 
 
 
187 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  25.6 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  20.11 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  22.09 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  23.03 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  23.03 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  22.97 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  24.16 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  22.67 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  25.47 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  22.09 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  21.84 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  23.7 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  25.88 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  21.3 
 
 
170 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  23.27 
 
 
171 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  23.53 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  23.53 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  24.31 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  24.82 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  25 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  23.38 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  21.71 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  24.84 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0076  DinB  20.12 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  24.11 
 
 
193 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  23.49 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  67.86 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  24.11 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  19.05 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  24.46 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  22.31 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  21.85 
 
 
202 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3935  DinB family protein  20.37 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  23.87 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  20.86 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>