61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5875 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  100 
 
 		 163 aa  343  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  76.54 
 
 		 191 aa  270  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  76.54 
 
 		 191 aa  270  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  72.78 
 
 		 190 aa  257  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  40.91 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  38.85 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  37.25 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  39.29 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  34.84 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  35.04 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  34.19 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  34.46 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  31.21 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  28.48 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.93 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  26.88 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  26.88 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  26.88 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  27.22 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  24.05 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  26.88 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  25 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  27.22 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  26.88 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  26.25 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  27.27 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  28.12 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  25.32 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  24.84 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  25.61 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  26.97 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  27.61 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  26.03 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  25.6 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  29.11 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  24.07 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  26.47 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  25.64 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  25 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  27.33 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  26.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  22.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  28.36 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  25.33 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  23.57 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  24.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  23.42 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  23.42 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  24.83 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  20.24 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  24.05 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  26.49 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  23.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  24.38 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  25 
 
 		 173 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  19.74 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  22.44 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>