24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0663 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  100 
 
 		 170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  41.84 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  42.36 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  38.1 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  37.59 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  38.73 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  34.55 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  34.55 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  31.93 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  34.19 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  38.93 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  34.46 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  32.17 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  29.49 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  28.21 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  29.2 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  28.4 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  25.95 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  26.92 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  28 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  67.86 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  30.56 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  25.95 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  26.71 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>