26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  37.04 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  32.47 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  34.13 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  32.72 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  32.72 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  32.52 
 
 		 186 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  28.48 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  34.46 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  27.71 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  27.71 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  29.33 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  29.94 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.29 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  27.16 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  26.58 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.27 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  27.08 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  22.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  27.08 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  25.79 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  47.73 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  27.32 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  20.45 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  20.69 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  20.45 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>