16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2412 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  83.83 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  41.82 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  47.53 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  40.12 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  33.33 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  37.59 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  35.76 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  32.64 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  32.64 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  30.19 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  32.72 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  31.21 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  30.87 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.49 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  34.92 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>