19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6208 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  45.68 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  47.53 
 
 		 167 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  45.06 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  41.44 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  42.36 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  31.33 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  35.54 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  34.46 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  29.87 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  33.99 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  33.99 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  32.52 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  33.56 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  27.04 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  23.24 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  30.48 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  21.67 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  26.24 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>