16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5321 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  42.94 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2157  DinB family protein  44.19 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.363263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2412  DinB family protein  40.12 
 
 		 167 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  41.44 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  40.4 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  39.29 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  37.74 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  37.74 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  37.84 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  38.1 
 
 		 170 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  34.13 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  31.21 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  31.54 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  26 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  27.21 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>