32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4197 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  100 
 
 		 154 aa  316  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  35.29 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  26.32 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  24.86 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  29.38 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  23.7 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  23.7 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  25.61 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  23.12 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  23.12 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  23.12 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  23.43 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  23.12 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  26.67 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  21.89 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  21.3 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  33.9 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  20.62 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  21.25 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  23.12 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5321  DinB family protein  27.21 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  30.49 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  22.42 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  23.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  24.07 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  22.88 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  20.37 
 
 		 169 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  23.84 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  22.29 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  20.86 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  23.57 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  22.94 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>