59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_2379 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  100 
 
 
170 aa  354  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  99.41 
 
 
174 aa  351  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  96.47 
 
 
174 aa  343  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  92.94 
 
 
174 aa  333  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  91.76 
 
 
174 aa  331  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  91.76 
 
 
170 aa  330  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  91.76 
 
 
174 aa  329  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  87.65 
 
 
176 aa  314  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  43.59 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  43.31 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  33.73 
 
 
169 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  37.87 
 
 
169 aa  94.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  32.93 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  27.63 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  28.48 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  26.88 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  26.25 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  26.8 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  26.25 
 
 
191 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  26.25 
 
 
191 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  28.99 
 
 
169 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  30.06 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  28.99 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  22.37 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  24.54 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  25.62 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  25.6 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  27.33 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  27.88 
 
 
173 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  22.5 
 
 
171 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  24.28 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  25.79 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  24.69 
 
 
178 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  24.68 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  21.89 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  26.45 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  23.39 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  25.16 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  25.95 
 
 
192 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  25.15 
 
 
173 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0076  DinB  20.93 
 
 
185 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  23.08 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  24.38 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  24.84 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  22.49 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1122  DinB family protein  26.28 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.214424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  22.84 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  24.12 
 
 
193 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  24.12 
 
 
193 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  28.81 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  20 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  27.97 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  26.03 
 
 
190 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  21.6 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  23.6 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  20.69 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>