66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0693 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  354  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  99.41 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  77.65 
 
 		 170 aa  283  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  51.18 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  51.48 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  52.94 
 
 		 170 aa  183  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  51.81 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  49.7 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  50.31 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  44.1 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  37.85 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  41.72 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  41.72 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  36.42 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  35.26 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  39.52 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  36.21 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  37.58 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  36.05 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  40.65 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  35.26 
 
 		 178 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  34.38 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  36.6 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  35.53 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  34.15 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  35.26 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  33.96 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  30 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  32.39 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  32.68 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  28.03 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  31.49 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  27.22 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  27.71 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  31.29 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  28.75 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  26.95 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  28.03 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  28.03 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  27.67 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  27.15 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  30.92 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  25.9 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  25.6 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  25.6 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  25.6 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  23.17 
 
 		 277 aa  51.6  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  25 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  25.6 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  24.68 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  23.35 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  23.72 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  25 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.53 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  26 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  24.71 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  24.85 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  26.54 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1122  DinB family protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.214424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  25.6 
 
 		 147 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  27.71 
 
 		 165 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>