36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2590 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  30.23 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  29.48 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  26.79 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  25.64 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  26.95 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  27.33 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  28.89 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  26.28 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  25.75 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  26.44 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  22.75 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  26.11 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  26.92 
 
 		 170 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  26.25 
 
 		 167 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  27.74 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  23.31 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  27.33 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  25.45 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  22.64 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  23.17 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  21.88 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  21.94 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  21.57 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  25.33 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  22.01 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  23.17 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  23.08 
 
 		 179 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  23.57 
 
 		 169 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  22.56 
 
 		 170 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  20.21 
 
 		 170 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  20.13 
 
 		 193 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  20.13 
 
 		 193 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  21.05 
 
 		 193 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  21.26 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  23.84 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>