76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1562 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  55.97 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  46.2 
 
 		 171 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  46.67 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  38.01 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  38.51 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  37.82 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  38.85 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  40.65 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  35.59 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  33.92 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  40.25 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  32.58 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  40.13 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  39.31 
 
 		 171 aa  91.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  38.82 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  30.91 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  30.91 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  31.87 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  36.54 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  35.95 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  32.72 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  32.72 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  31.87 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  31.32 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  29.89 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  29.82 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  32.56 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  31.18 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  33.12 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  33.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  33.54 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  32.92 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  25 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  34.84 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  33.13 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  32.69 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  22.75 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  30.06 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  25.3 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  27.1 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  32.05 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  26.32 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  29.61 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  27.03 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  26.63 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  26.19 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  26.25 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  25.62 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  28.83 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  25.62 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25.32 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  25.62 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  27.91 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  27.91 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  24.4 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  26.14 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  24.68 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25.79 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  24.16 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  24.68 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  24.84 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  25.3 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  25.85 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  36.54 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  26.71 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>