44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3885 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  100 
 
 		 167 aa  350  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  99.4 
 
 		 167 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  40.51 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  35.54 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  34.97 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  30.49 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  30.91 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  33.72 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  28.25 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  30.18 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  31.51 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  30.12 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  29.7 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  28.39 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  33.33 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  28.37 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  30 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  27.65 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  28.05 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  24.84 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  27.22 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  29.19 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  27.15 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  27.22 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  25 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  28.48 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  24.84 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  24.28 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  27.39 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  26.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  28.28 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  22.89 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  28.97 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  27.04 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  28.85 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  23.93 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  27.75 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  25.32 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  25.95 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>