54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3562 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  55.08 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  55.61 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  54.7 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  50.83 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  49.72 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  49.72 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  47.92 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  49.71 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  33.75 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  34.64 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  32.5 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  34.64 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  32.08 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  31.65 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  30.38 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  31.25 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  31.17 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3027  hypothetical protein  51.72 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0464615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  32.68 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  30.06 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  29.37 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  29.3 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  30.37 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  28.93 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  30.54 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  29.93 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  29.63 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  26.79 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  28.66 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  26.75 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  24.38 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  25.3 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  24.38 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  24.2 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  31.29 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  30.06 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  27.66 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  26.12 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  26.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  25.81 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  28.03 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  24 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  25 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  24.31 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  23.57 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  27.27 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  20.29 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  26.45 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  23.84 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25.62 
 
 		 176 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>