63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2186 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  91.38 
 
 		 174 aa  332  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  90.23 
 
 		 174 aa  327  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  88.51 
 
 		 174 aa  323  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  87.36 
 
 		 174 aa  321  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  87.36 
 
 		 174 aa  321  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  86.78 
 
 		 174 aa  318  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  86.21 
 
 		 174 aa  315  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  87.65 
 
 		 170 aa  314  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  86.47 
 
 		 170 aa  308  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  41.21 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  39.39 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  34.3 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  36.52 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  27.33 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  31.36 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  27.67 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  26.63 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  27.22 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  28.57 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  25.32 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  25.32 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  25.15 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  25.32 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  27.54 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  23.93 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  27.54 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  23.42 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  26.54 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  23.95 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  23.43 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0076  DinB  24.7 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  23.31 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  25.15 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1122  DinB family protein  25.77 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.214424  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  24.4 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  24.4 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  22.84 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  24.58 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  22.36 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  21.95 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  22.16 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  25.45 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  21.89 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  24.83 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  25.3 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  19.63 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  22.41 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  24.42 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  25.9 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  22.95 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  25.17 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  22.84 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  26.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  24.69 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  21.67 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0987  DinB family protein  20.63 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  23.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  25.3 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  25.62 
 
 		 187 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  23.12 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  24.81 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>