45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1538 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3258  general secretory system II protein E domain protein  49.67 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  31.47 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  29.45 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  28.15 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  28.99 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  25.87 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  30.63 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  22.97 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  26.09 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  29.3 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  26.45 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  26.45 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  26.45 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  26.09 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  24.59 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  24.59 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  30.22 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  27.27 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  26.45 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  22.76 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  26.27 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  27.69 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  25.71 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  25 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  24.83 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  26.43 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  27.48 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2571  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2381  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.553402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2558  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.735776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2338  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000328354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2614  hypothetical protein  29.5 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  25.68 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  28.06 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.67 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2560  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.079695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  29.6 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  25.36 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  22.35 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2370  DinB family protein  28.06 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00332574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0838  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2299  hypothetical protein  26.47 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>