16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3258 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3258  general secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  49.01 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  26.28 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  31.79 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  28 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  29.41 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  31.65 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  25 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  25.17 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2560  hypothetical protein  29.79 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.079695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  26.19 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  26.19 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  22.39 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2370  DinB family protein  30.28 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00332574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  31.97 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  25.22 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>