23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1545 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  100 
 
 
163 aa  339  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3935  DinB family protein  43.28 
 
 
157 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  31.45 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  25.62 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  33.83 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  26.09 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  25.62 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  25.62 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  25.62 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  25.16 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  24.26 
 
 
174 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  28.31 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  23.75 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  26.43 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  22.79 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  23.53 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  22.79 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  25.81 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  22.36 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  26.71 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  25.79 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  22.62 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  26.35 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>