58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6952 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  100 
 
 		 164 aa  344  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  34.97 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  33.75 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  31.13 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  25 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  28.83 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  26.71 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  27.74 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  25.81 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  25.81 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  26.39 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  29.41 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  26.32 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  27.54 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  28.24 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  29.7 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  27.08 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  30.41 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  29.56 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  23.08 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  23.08 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25.77 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  25 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  23.08 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  24.54 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25.15 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  25 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  25 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  28.67 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  27.63 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  22.37 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  24.36 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  22.38 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  24.18 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  25 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  24.36 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  26.17 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  27.27 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  25.32 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  28.19 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  29.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  26.99 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  24.54 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  24.39 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  23.93 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  23.72 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  24.05 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  23.42 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  23.33 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  23.64 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  24.22 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  27.33 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  23.13 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  24.05 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  23.84 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  26.35 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  41.86 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>