24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2406 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  100 
 
 		 147 aa  308  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  31.47 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  30.58 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  30.19 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  28.76 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  26.67 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  28.48 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  23.42 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  28.06 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  25.5 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  24.68 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  25.6 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  30.46 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  25.17 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  25.5 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  23.33 
 
 		 168 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  29.71 
 
 		 174 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  28.78 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  24.4 
 
 		 170 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  25.6 
 
 		 170 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  27.21 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  26.92 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  24.85 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.53 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>