34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1093 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  45.73 
 
 		 165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  31.13 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  30.07 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  34.19 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  31.61 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  31.36 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  30.41 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  31.95 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  31.61 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  30.41 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  31.29 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  29.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  27.92 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  29.24 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  30.18 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  30.18 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  30.06 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  28 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  29.59 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  26.75 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  28.48 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  27.03 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  28.83 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  28.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  25.69 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  25.93 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  21.26 
 
 		 277 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  23.81 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  26.54 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  26.54 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  25.35 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  24.31 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  28.14 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>