53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0713 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  100 
 
 		 165 aa  343  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  47.27 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  48.72 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  46.67 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  36.02 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  40.34 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  34.64 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  38.96 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  38.51 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  35 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  35.37 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  34.81 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  33.53 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  32.93 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  36.36 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  33.95 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  34.44 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  33.96 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  31.37 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  30.3 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  29.17 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  30.23 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  29.7 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  36.05 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  32.32 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  32.69 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  33.75 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  34.44 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  34.18 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  33.33 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  33.97 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  25.73 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  28.05 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  27.56 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  30.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  29.65 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  29.03 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  25.45 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  29.03 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  26.67 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  32.47 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  25.3 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  25.3 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  24.05 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  25.79 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  22.78 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  23.75 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  26.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  24.46 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  24.68 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  28.03 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  26.99 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>