58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1368 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  52.27 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  48.54 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  44.63 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  43.82 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  41.67 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  40.12 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  41.32 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  38.46 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  36.05 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  40 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  36.05 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  36.69 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  35.12 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  39.77 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  32.16 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  39.39 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  38.82 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  34.16 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  33.53 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  34.52 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  34.3 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  34.57 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  33.74 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  34.36 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  31.68 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  29.82 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  30.12 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  30.12 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  31.52 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  28.89 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  28.4 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  28.57 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  26.62 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  26.09 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  29.34 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  22.89 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  27.06 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  25.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  25.9 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  25.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  27.61 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  24.07 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  24.85 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  22.09 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  24.58 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  26.09 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  25.43 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  25.28 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  25.28 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25.28 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  25.28 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  25.7 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  25.28 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  24.85 
 
 		 166 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  25 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>