70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3043 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  97.63 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  69.09 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  41.72 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  41.72 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  43.4 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  40.49 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  41.21 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  38.99 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  37.27 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  39.87 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  34.97 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  37.27 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  33.91 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  37.5 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  34.08 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  32.58 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  32.93 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  30.23 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  33.33 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  28.81 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  33.95 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  35.37 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  32.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  33.75 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  32.91 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  30.13 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  28.99 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  28.99 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  28.99 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  28.4 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  25.93 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  25.86 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  27.38 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  25.64 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  25.31 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  28.4 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  25.93 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  27.46 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  26.01 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  26.47 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  26.45 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  27.54 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  32.52 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  24.36 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  32.52 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  27.22 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  22.64 
 
 		 277 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  27.22 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  31.29 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0789  DinB family protein  24.82 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  26.35 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  28.05 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  29.63 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  31.14 
 
 		 193 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4731  DinB family protein  23.81 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1122  DinB family protein  26.14 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.214424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  26.11 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5875  DinB family protein  23.42 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32370  putative DNA damage-inducible gene  27.08 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00347852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6089  DinB  23.12 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1988  DinB family protein  23.12 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  28.29 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  29.31 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  28.19 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  23.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0362  DinB family protein  21.52 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  29.31 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4739  DinB family protein  24.46 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>