43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2470 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  100 
 
 		 167 aa  350  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  99.4 
 
 		 167 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  40.51 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  34.94 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  34.36 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  30.91 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  30.91 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  33.72 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  27.68 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  30 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  31.51 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  30.36 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  30.3 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  28.85 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  28.39 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  32.94 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  28.03 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  29.37 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  27.65 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  29.38 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  28.05 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  24.84 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  27.22 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  27.15 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  27.22 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  29.01 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  24.84 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  25 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  28.48 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  24.28 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  27.39 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  26.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  28.38 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  24.54 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  27.04 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  28.97 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  28.85 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  22.29 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  27.59 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  27.75 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  25.32 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>