13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3935 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3935  DinB family protein  100 
 
 		 157 aa  327  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1545  DinB family protein  43.28 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  24.68 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  28 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  26.09 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  24.4 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  23.4 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  26.45 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  24.44 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  23.49 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  24.18 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  20.37 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  25 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>