25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0076 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0076  DinB  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2409  DinB family DNA polymerase  22.64 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  24.7 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  22.01 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  21.74 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  21.74 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3478  hypothetical protein  28.12 
 
 
162 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.609177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  20.93 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3252  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0302747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1770  hypothetical protein  28.75 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00553228  normal  0.588204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3195  hypothetical protein  28.05 
 
 
162 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  20.93 
 
 
174 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  20.93 
 
 
170 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  20.93 
 
 
174 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3496  DinB family  27.44 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3508  hypothetical protein  28.05 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.559938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2154  DinB protein  20.93 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00671256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3491  hypothetical protein  27.61 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000421568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2560  hypothetical protein  25.33 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.079695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  20.12 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3191  DinB family protein  27.5 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2628  DinB family protein  23.17 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3539  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.509353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3282  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0481005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2413  DinB family protein  51.43 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>