159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30050  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 
289 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  29.24 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  32.37 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  32.37 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  32.37 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1554  putative glutamine amidotransferase  30.1 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  26.75 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  26.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  28.24 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  30.04 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  22.82 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  26.03 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  26.03 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  30.41 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  31.82 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2388  glutamine amidotransferase, class-II  34.25 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.570173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  24.63 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  30.71 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2065  glutamine amidotransferase, class-II protein  34.43 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  29.17 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  29.11 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  29.47 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  31.11 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  25.51 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  29.47 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  35.25 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  28.98 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  31.5 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  28.05 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  28.98 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  28.98 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  29.55 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  29.55 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  29.44 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  29.55 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  28.77 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  23.94 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  23.94 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  25.34 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  25.34 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  25.74 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  27.78 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  22.33 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  25.74 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  24.88 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  31.15 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  27.23 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  27.83 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  28.39 
 
 
266 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  31.36 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  24.52 
 
 
529 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  28.39 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  37.25 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  23.41 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  26.96 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  30.11 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  27.13 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  25.11 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  29.84 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  29.84 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  23.44 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  26.49 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  26.49 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  23.94 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  28.8 
 
 
328 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  27.62 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  26.29 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  28.89 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  26.71 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  27.12 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  21.89 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  28.8 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  27.67 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.95 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  28.8 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  27.03 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  24.03 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  31.37 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  28.8 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  25.28 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  25.71 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  29.44 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  28.27 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 
610 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  23.16 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0093  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
609 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  25.71 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  25.71 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  28.27 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>