168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6587 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  51.82 
 
 
277 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  49.82 
 
 
277 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  51.46 
 
 
277 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  49.45 
 
 
277 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  51.09 
 
 
279 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  50.91 
 
 
277 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  50.18 
 
 
277 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  50.36 
 
 
306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  50.36 
 
 
288 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  50.36 
 
 
277 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  49.09 
 
 
340 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  49.46 
 
 
297 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  49.46 
 
 
297 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  50.37 
 
 
277 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  49.28 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  49.09 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  41.3 
 
 
263 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  39.18 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  40.15 
 
 
275 aa  212  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  41.18 
 
 
274 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  38.69 
 
 
270 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  39.55 
 
 
261 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  38.69 
 
 
263 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  42.86 
 
 
254 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  38.1 
 
 
270 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  37.59 
 
 
271 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  38.55 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
264 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
264 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  37.73 
 
 
264 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  37.09 
 
 
258 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  37.55 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  37.55 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  35.74 
 
 
269 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  35.43 
 
 
275 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  39.61 
 
 
261 aa  185  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  36.19 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  38.11 
 
 
261 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  39.22 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  34.6 
 
 
287 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  36.19 
 
 
274 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
287 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  40.96 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  36.03 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  35.11 
 
 
283 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  35.09 
 
 
283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  32.4 
 
 
359 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  34.17 
 
 
264 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 
295 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  34.34 
 
 
262 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  34.34 
 
 
262 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  32.36 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  29.56 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  32.45 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  34.55 
 
 
431 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  28.8 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  32.13 
 
 
260 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  32.19 
 
 
529 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  29.93 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  28.44 
 
 
406 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  28.29 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  29.55 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  30.22 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  33.33 
 
 
245 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  30.05 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  32.81 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  32.77 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  33.12 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  31.2 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  29.91 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  32.68 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  30.77 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  23.49 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  26.82 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  35.54 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  23.49 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  33.55 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  33.8 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  29.38 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  35.54 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  26.37 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  26.28 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  33.08 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1360  glutamine amidotransferase, class-II  29.24 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1259  glutamine amidotransferase, class-II  29.24 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2589  glutamine amidotransferase, class-II  27.2 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  27.7 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  27.2 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  32.2 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  28.74 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>