More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1678 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  100 
 
 
287 aa  591  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  98.95 
 
 
287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  90.19 
 
 
269 aa  507  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  59.44 
 
 
274 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  59.76 
 
 
270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  58.98 
 
 
270 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  54.09 
 
 
271 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  57.61 
 
 
264 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  54.69 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  54.69 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  55.74 
 
 
258 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  53.96 
 
 
263 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  53.12 
 
 
264 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  55.04 
 
 
260 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  56.43 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  53.53 
 
 
261 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  51.38 
 
 
261 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  50.99 
 
 
261 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  50.59 
 
 
261 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  47.35 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  47.35 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  47.56 
 
 
254 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  46.59 
 
 
279 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  47.77 
 
 
275 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  48.45 
 
 
274 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  38.91 
 
 
275 aa  222  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  40.65 
 
 
275 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  51.85 
 
 
218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  42.49 
 
 
281 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  40.51 
 
 
277 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  40.51 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  41.96 
 
 
306 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  41.96 
 
 
288 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  41.96 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  40.66 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  40.61 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  41.57 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  41.98 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  39.93 
 
 
277 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  41.29 
 
 
297 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  41.29 
 
 
297 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  38.69 
 
 
340 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  38.69 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  34.6 
 
 
277 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  38.57 
 
 
279 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  32.65 
 
 
359 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  32.5 
 
 
283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  32.5 
 
 
283 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  38.72 
 
 
262 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  35.98 
 
 
262 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  35.98 
 
 
262 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  40.08 
 
 
271 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  35.47 
 
 
264 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  35.67 
 
 
381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  29.59 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  35.82 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  34.07 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  37.24 
 
 
431 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  30.86 
 
 
529 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  33.98 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  31.76 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  31.72 
 
 
406 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  31.75 
 
 
243 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  31.37 
 
 
248 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  30.16 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  31.75 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  32.2 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  29.8 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  30.15 
 
 
257 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  29.46 
 
 
252 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  30.56 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  32.41 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  29.43 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  30.15 
 
 
257 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  29.96 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  29.2 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  30.16 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  24.92 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  31.34 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  38.26 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  27.54 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  24.26 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  28.52 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  29.85 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  26.62 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  25.28 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  25.28 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  25.28 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  28.34 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  29.07 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  27.82 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>