More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5315 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  52.96 
 
 
287 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  52.28 
 
 
285 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  54.51 
 
 
294 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  50.51 
 
 
296 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  50.86 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  47.93 
 
 
288 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  46.94 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  43.29 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  42.07 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  43.42 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  42.07 
 
 
257 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  31.65 
 
 
273 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  31.91 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  29.77 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  32.95 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  26.95 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  28.02 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  30.04 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  28.9 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  28.52 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  28.09 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  28.52 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  28.09 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  27.65 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  29.63 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  28.79 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  30 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  30.48 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  31.41 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  30.1 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  27.97 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  27.54 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  30.89 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  27.21 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  27.55 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  27.03 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  24.24 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  29.78 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  29.97 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  28.92 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  25.94 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  27.04 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  27.55 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  27.48 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  25.17 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  28.21 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  29.7 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  31.82 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  27.04 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  28.2 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  30.45 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  29.67 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  28.95 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  27.53 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  27.03 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  27.03 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  27.03 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  28.95 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  30.07 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  28.11 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  29.34 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  29.97 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  28.11 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  29.9 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  26.36 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  30.07 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  28.85 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  29.27 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  26.82 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  30.07 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  28.77 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  25.37 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  30.72 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  30.65 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  30.56 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  30.22 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  30.22 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  25.23 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  29.55 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  27.07 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  29.01 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  28.62 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  31.06 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  30.22 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  29.22 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  32.92 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  33.9 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  33.95 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  36.08 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>