More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2281 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  36.13 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  36.63 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  35.4 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  35.04 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  27.11 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  27.11 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  28.01 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2589  glutamine amidotransferase, class-II  30.04 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1360  glutamine amidotransferase, class-II  29.33 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  23.96 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1259  glutamine amidotransferase, class-II  29.33 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  32.22 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  31.97 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  30.34 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  31.97 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  32.23 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  31.97 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  27.02 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  31.85 
 
 		 340 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  31.37 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  31.73 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  31.23 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  29.59 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  31.65 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  27.43 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  30.71 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  26.39 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  26.39 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  30.37 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  31.93 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  33.96 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  33.96 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  31.87 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  29.17 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  29.62 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  28.52 
 
 		 231 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  26.77 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  30.1 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  27.93 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  31.73 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  29.15 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  31.44 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  31.44 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  28.78 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  29.15 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  30.55 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  28.12 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  29.89 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  28.68 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  29.96 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  27.8 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  32.09 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  25.18 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  29.67 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  29.59 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  30.19 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  29.81 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  27.94 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  28.72 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  28.2 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  28.52 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  28.52 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  27.54 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  28.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  28.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  28.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  28.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1271  glutamine amidotransferase, class-II  26.3 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  28.2 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  28.2 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  28.2 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  28.2 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  28.3 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  28.68 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  28.68 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  28.68 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  28.68 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  28.68 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  32.83 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12401  predicted protein  30.66 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  31.7 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  28.67 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  27.24 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  28.57 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  31.54 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  30.19 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  30.77 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>