156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12401 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12401  predicted protein  100 
 
 
277 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12612  predicted protein  49.44 
 
 
258 aa  275  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  47.65 
 
 
259 aa  255  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  45.85 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  47.65 
 
 
301 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  49.82 
 
 
277 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  49.1 
 
 
276 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  49.1 
 
 
276 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  47.65 
 
 
303 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  48.74 
 
 
276 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  49.1 
 
 
276 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  47.29 
 
 
304 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  47.29 
 
 
304 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  48.74 
 
 
260 aa  245  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  46.93 
 
 
328 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  47.29 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  47.29 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  48.74 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  46.21 
 
 
316 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  46.21 
 
 
304 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  47.12 
 
 
311 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  46.21 
 
 
304 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  46.21 
 
 
304 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  46.21 
 
 
304 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  46.21 
 
 
304 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  47.12 
 
 
311 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  45.49 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  46.21 
 
 
304 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  45.13 
 
 
275 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  49.1 
 
 
268 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  46.13 
 
 
298 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  46.13 
 
 
299 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  43.43 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  43.07 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  43.07 
 
 
255 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  43.43 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  43.43 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  46.93 
 
 
255 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  43.07 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  43.07 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  43.07 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  43.07 
 
 
255 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  45.77 
 
 
262 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  45.33 
 
 
265 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  42.7 
 
 
255 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  44.77 
 
 
261 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  42.96 
 
 
281 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  46.57 
 
 
255 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  45.85 
 
 
276 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  46.93 
 
 
255 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  42.6 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  42.6 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  42.6 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  42.6 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  42.6 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  43.07 
 
 
255 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  42.96 
 
 
281 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  42.6 
 
 
255 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  46.57 
 
 
255 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  41.61 
 
 
255 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  41.16 
 
 
275 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  47.65 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  43.32 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  42.45 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  43.17 
 
 
258 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  41.97 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  42.65 
 
 
259 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  41.97 
 
 
255 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  41.16 
 
 
268 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  41.73 
 
 
259 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  41.24 
 
 
257 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  41.24 
 
 
257 aa  215  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  44.77 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  42.09 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  43.17 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  41.24 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  42.09 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  41.73 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  41.73 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  41.73 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2065  glutamine amidotransferase, class-II protein  41.22 
 
 
307 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  42.35 
 
 
301 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2388  glutamine amidotransferase, class-II  41.22 
 
 
307 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.570173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  43.32 
 
 
262 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  43.32 
 
 
266 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  42.09 
 
 
258 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  41.73 
 
 
261 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  42.35 
 
 
273 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  41.88 
 
 
283 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  41.88 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  41.61 
 
 
257 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  44.44 
 
 
252 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  44.77 
 
 
252 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  41.88 
 
 
257 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  41.88 
 
 
257 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  42.6 
 
 
257 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  41.88 
 
 
257 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  40 
 
 
265 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  39.35 
 
 
259 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  39.73 
 
 
304 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>