164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12612 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12612  predicted protein  100 
 
 		 258 aa  540  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12401  predicted protein  49.44 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  39 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  39 
 
 		 316 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  39 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  39 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  39 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  38.76 
 
 		 301 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  39 
 
 		 304 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  40.08 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  39 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  39.69 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  37.84 
 
 		 327 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  39.77 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  39.53 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  39.53 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  38.61 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  38.61 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  40.31 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  38.22 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  38.22 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  39 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  39.92 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  39 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  40.47 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  39.15 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  39.15 
 
 		 257 aa  184  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  40.31 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  39.06 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  37.8 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  39.92 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  39.92 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  37.01 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  40.82 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  37.25 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  39.62 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  37.98 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  38.43 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  39.92 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  37.6 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  38.76 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  38.76 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  37.89 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  38.91 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  38.52 
 
 		 263 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  36.05 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  37.5 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  37.84 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  36.72 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  37.35 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  37.45 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  37.84 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  37.35 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  35.27 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  37.35 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  34.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  34.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  34.88 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  34.88 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  34.88 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  34.88 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  34.88 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  34.88 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  34.88 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  34.88 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  37.1 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  34.75 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  37.6 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  36.29 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  33.59 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  33.59 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  37.45 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  34.11 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  34.88 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  36.72 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  36.72 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  33.98 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  36.86 
 
 		 301 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  36.86 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  36.22 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  33.98 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  34.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  34.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  34.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  34.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  34.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  36.29 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  34.11 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  37.25 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2388  glutamine amidotransferase, class-II  34.39 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.570173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  34.51 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  35.11 
 
 		 304 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  34.87 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  33.98 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  33.98 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  33.46 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  35.77 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2065  glutamine amidotransferase, class-II protein  34.04 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  33.59 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>